西晉太康三年(282)，朝廷分原烏程縣西另立新縣，稱“長(zhǎng)城縣”，因春秋時(shí)吳王闔閭使弟夫概于此筑城，因城狹長(zhǎng)，得名“長(zhǎng)城”。
縣以古遺址得名，屬吳興郡。
南朝宋、齊、梁、陳四朝，長(zhǎng)城縣均屬吳興郡。
隋開(kāi)皇九年(589)撤長(zhǎng)城縣再入烏程縣，屬蘇州郡；仁壽二年(602)復(fù)立長(zhǎng)城縣，屬湖州。
隋末(618)江南豪強(qiáng)沈法興于縣境置長(zhǎng)州，唐武德四年(621)置綏州，約六年(623)更名雉州，并以原鄉(xiāng)縣附，七年（624）廢雉州，復(fù)名長(zhǎng)城縣，并以原鄉(xiāng)、安吉兩縣入。
麟德元年(664)復(fù)以安吉縣出。
五代屬吳越國(guó)。
后梁開(kāi)平四年(910)，吳越王錢(qián)镠為避后梁朱溫廟諱，改長(zhǎng)城縣為長(zhǎng)興縣。
地名含義“祈福吳越國(guó)長(zhǎng)存興旺”。
元至元十三年(1276)屬湖州路，元元貞元年（1295）升長(zhǎng)興為州，稱長(zhǎng)興州，仍屬湖州路。
明太祖丁酉年（1357）更名長(zhǎng)安州，以安吉縣附，壬寅年（1362）復(fù)名長(zhǎng)興州，洪武二年（1369）降州為縣。
清順治二年(1645)隸湖州府。
1912年民國(guó)建立，湖州府廢，直屬浙江省。
1928年長(zhǎng)興縣屬第一行政督察區(qū)，1936屬第二行政區(qū)。
1947年，行政區(qū)劃調(diào)整，全縣重組為24個(gè)鄉(xiāng)鎮(zhèn)級(jí)行政單位。
1949年5月16日，長(zhǎng)興縣人民政府成立，全縣設(shè)7區(qū)、26鄉(xiāng)鎮(zhèn)，隸浙江省第一區(qū)專員公署，1951年4月，隸嘉興地區(qū)專員公署,1956年5月，全縣行政區(qū)劃調(diào)整，撤區(qū)并鄉(xiāng)，設(shè)2鎮(zhèn)、24鄉(xiāng)，后鄉(xiāng)鎮(zhèn)級(jí)行政區(qū)劃一直微調(diào)中。
1983年10月，隸湖州市。
之后1992年、1998年、2000年、2012年、2015年，長(zhǎng)興縣實(shí)施了五次鄉(xiāng)鎮(zhèn)級(jí)行政區(qū)劃調(diào)整合并。
截至2015年，長(zhǎng)興縣轄雉城、畫(huà)溪、太湖、龍山4街道，夾浦、洪橋、李家巷、和平、虹星橋、林城、泗安、小浦、煤山9鎮(zhèn)，水口、呂山2鄉(xiāng)，后行政區(qū)劃不再變更。