清朝時屬二甲。
1939年屬五區(qū)。
1950年屬三區(qū)敦仁鄉(xiāng)；1951年屬三區(qū)設苞谷腦鄉(xiāng)；1958年屬紅專人民公社稱苞谷腦管理區(qū)；1961年屬苞谷腦區(qū)稱苞谷腦公社；1970年屬苞谷腦公社稱苞谷腦大隊；1982年改寫為包谷垴公社包谷垴大隊；1984年屬包谷垴區(qū)稱包谷垴鎮(zhèn)，1988年屬包谷垴鄉(xiāng)稱包谷垴行政村；2000年屬包谷垴鄉(xiāng)稱包谷垴村民委員會；2013年屬包谷垴鄉(xiāng)改稱包谷垴社區(qū)居民委員會，自得名以來沿用至今。