“十二邦”時(shí)期，屬“象雄阿爾巴（后為孫波雅松）”轄區(qū)。
唐時(shí)邊壩屬吐蕃。
元代屬吐蕃等路宣慰使司都元帥府。
1642年，噶丹頗章政權(quán)在邊壩縣境內(nèi)設(shè)立達(dá)爾宗（今邊壩縣邊壩鎮(zhèn)）、結(jié)登宗（今邊壩縣沙丁鄉(xiāng)），歸西藏地方政府管理。
康熙五十九年（1720），清軍平定西藏，駐扎邊壩，屬察木多管轄。
清乾隆十三年（1748），清廷于丹達(dá)設(shè)行臺(tái)，派兵戍守，稱丹達(dá)塘。
乾隆十六年（1751），清廷將邊壩劃歸駐藏大臣直接管轄。
清朝末年，趙爾豐“改土歸流”時(shí)，將邊壩劃入碩督縣轄。
1918年，西藏地方政府在今邊壩縣境內(nèi)設(shè)邊壩宗和沙丁宗（結(jié)登宗）。
1943年，西藏地方政府隊(duì)推行宗谿制，在邊壩境內(nèi)仍設(shè)邊壩宗和沙丁宗，歸“朵麥基巧”管轄。
1950年，昌都解放，同年11月，邊壩宗、沙丁宗解放。
1951年1月，兩宗劃歸第一辦事處（丁青辦事處）管轄，隸屬昌都解放委員會(huì)，11月，邊壩宗、沙丁宗分別成立解放委員會(huì)，宗政權(quán)被宗解放委員會(huì)取代。
1956年，成立“昌都基巧辦事處”邊壩和沙丁兩宗歸其管理。
1959年4月，邊壩宗、沙丁宗人民解放委員會(huì)撤銷(xiāo)；同時(shí)，解散宗政府。
1960年1月，經(jīng)國(guó)務(wù)院批準(zhǔn)，同意撤銷(xiāo)邊壩宗和沙丁宗，合并設(shè)置邊壩縣。
隸屬昌都專員公署。
1970年，改屬昌都地區(qū)。
2014年，昌都地區(qū)撤地設(shè)市，邊壩縣屬昌都市管轄。