隋朝時(shí)期，金山鎮(zhèn)境域?qū)偌沃萜角伎h，后屬榮州大牢縣。
唐朝時(shí)期，為榮州應(yīng)靈縣治地。
明末清初，屬犍為縣清流鄉(xiāng)。
民國(guó)二十四年（1935年），設(shè)金山鎮(zhèn)。
民國(guó)三十年（1941年），屬犍為縣第四區(qū)。
民國(guó)三十一年（1942年），金山鎮(zhèn)改鄉(xiāng)。
1951年，屬犍為縣第四區(qū)。
1952年10月，為五通橋市第四區(qū)駐地，屬新勝鄉(xiāng)。
1955年，設(shè)五通橋市金山鎮(zhèn)。
1956年，與新勝、金燕小鄉(xiāng)合并為金山鄉(xiāng)。
1958年，鄉(xiāng)改公社。
1959年，與輝山公社合并為金輝公社。
1961年，析置金山公社。
1962年，分為金山鎮(zhèn)和金山公社。
1984年4月，公社改鄉(xiāng)。
1987年，金山鄉(xiāng)并入金山鎮(zhèn)。
1992年，鹽林、金燕2鄉(xiāng)并入金山鎮(zhèn)。
2001年9月，設(shè)金山寺居民委員會(huì)。
2019年12月13日，撤銷(xiāo)輝山鎮(zhèn)，將其所屬行政區(qū)域劃歸金山鎮(zhèn)管轄。