清順治年間（1644~1661年），屬巴州長樂鄉(xiāng)。
道光二年（1822年），屬太平縣七鄉(xiāng)。
民國三年（1914年），太平縣改名萬源縣。
民國二十二年（1933年），紅軍建區(qū)蘇維埃和2個(gè)鄉(xiāng)蘇維埃，屬紅勝縣蘇維埃。
民國二十四年（1935年）3月，改為石窩鎮(zhèn)。
民國二十六年（1937年），趕場壩聯(lián)保處并入石窩鎮(zhèn)。
民國二十九年（1940年），改鄉(xiāng)公所。
1950年12月，成立石窩鄉(xiāng)，屬黃鐘鎮(zhèn)。
1951年3月，改屬草壩區(qū)。
1958年3月，改為金山公社。
1964年，更名石窩公社。
1983年2月，公社改鄉(xiāng)。
2015年12月，撤石窩鄉(xiāng)建石窩鎮(zhèn)。