1950年建中子鄉(xiāng)，設(shè)小屯村。
1958年轉(zhuǎn)斗鄉(xiāng)并入后成立中子人民公社，小屯村更名為小屯大隊。
1961年分出原轉(zhuǎn)斗鄉(xiāng)境成立轉(zhuǎn)斗人民公社。
1984年中子人民公社更名為中子鄉(xiāng)，中子人民公社小屯大隊更名為中子鄉(xiāng)小屯村，同時設(shè)立中子鄉(xiāng)小屯村村民委員會，境域未變。
1992年撤鄉(xiāng)建鎮(zhèn)，中子鄉(xiāng)與轉(zhuǎn)斗鄉(xiāng)合并成立中子鎮(zhèn)，中子鄉(xiāng)小屯村村民委員會更名為中子鎮(zhèn)小屯村村民委員會。
1995年原轉(zhuǎn)斗鄉(xiāng)從中子鎮(zhèn)析出復(fù)置轉(zhuǎn)斗鄉(xiāng)，小屯村隸屬中子鎮(zhèn)，此后境域一直未變。
2020年5月南埡村與小屯村合并為小屯村，撤銷南埡村村民委員會，設(shè)立小屯村村民委員會，隸屬隸屬中子鎮(zhèn)。