1951年，屬巴中縣尹家鄉(xiāng)管轄。
1958年，設(shè)立水磨壩管理區(qū)，又稱第四管區(qū)。
1962年，更名為水磨壩生產(chǎn)大隊(duì)，簡稱水磨壩大隊(duì)，又稱四大隊(duì)。
1969年，更名為水磨壩大隊(duì)革命委員會(huì)。
1981年，復(fù)名水磨壩生產(chǎn)大隊(duì)。
1984年，全國實(shí)行政社分設(shè)，撤銷水磨壩生產(chǎn)大隊(duì)，設(shè)立水磨壩村村民委員會(huì)，簡稱水磨壩村村委會(huì)。
1993年，屬巴中市（縣級(jí)）尹家鄉(xiāng)管轄。
2000年，屬巴中市巴州區(qū)尹家鄉(xiāng)管轄。
2013年，屬巴中市恩陽區(qū)尹家鄉(xiāng)管轄。
2017年2月，撤鄉(xiāng)設(shè)鎮(zhèn)，屬尹家鎮(zhèn)管轄，沿用至今。