1922年,花果園村隸屬襄垣縣第三區(qū)第十三編村(主村北南坪)所轄。
清宣統(tǒng)元年(1909),花果園村隸屬襄垣縣北南坪保所轄。
1937年,花果園村隸屬襄垣縣第三區(qū)北南坪編村所轄。
1953年6月,花果園村隸屬襄垣縣第五區(qū)南坪鄉(xiāng)所轄。
1956年,花果園村隸屬襄垣縣南煙(巖)鄉(xiāng)所轄。
1958年9月,該村隸屬襄垣縣下良人民公社所轄,稱花果園村管理區(qū)。
1959年9月,該村隸屬襄垣縣西營人民公社所轄,稱花果園生產(chǎn)大隊(duì)。
1984年4月,該村隸屬襄垣縣西營鎮(zhèn)所轄,稱花果園村村民委員會(huì)至今。