1949年屬太原第二專署（晉源）下轄的一個自然村；1951年屬第六區(qū)（晉源）下轄的一個自然村，1954年，屬晉源區(qū)。
1958年8月29日，晉源鎮(zhèn)改制為晉源人民公社，屬郊區(qū)。
1961年5月18日，復置晉源人民公社。
1971年屬南郊區(qū)晉源人民公社下轄的一個生產大隊；80年代屬鵝歸店大隊，1984年5月9日，改制為晉源鎮(zhèn)，轄鵝歸店村村民委員會。
1997年設晉源區(qū)，2001年撤銷晉源鎮(zhèn)，設立晉源街道辦事處。
鵝歸店村村民委員會屬于晉源區(qū)晉源街道，一直沿用至今。