春秋時期，晉國翟氏定居于此，故名瞿村。
1942年汾河決口，南瞿被淹，西頭村民大部分遷入北瞿，東頭村民遷于北二里高地新建，故名南瞿村。
解放初屬陽曲縣。
1958年8月，中共中央作出《關于在農村建立人民公社問題的決議》，我國全面開展人民公社化運動，實行政社合一、撤鄉(xiāng)建社，農業(yè)生產合作社改稱生產大隊。
1970年歸北郊區(qū)。
1983年10月，中共中央、國務院聯合發(fā)出《關于實行政社分開建立鄉(xiāng)政府的通知》，要求實行政社分開，恢復鄉(xiāng)，建立鄉(xiāng)人民政府。
同時，生產大隊更名為村，撤銷生產大隊管理委員會，選舉產生村民委員會。
1998年劃歸尖草坪區(qū)，屬向陽鎮(zhèn)管轄。