南堡子村自古以來就屬周、秦、漢、唐、宋、元、明、清管轄;五代十國前期屬岐;公元955年屬后周,公元960年屬北宋;公元1127-1234年屬金;1958年8月建立南堡子生大隊,同時設(shè)立大隊黨支部,隸屬義門人民公社;同年10月劃歸北極人民公社;1961年5月改歸水簾人民公社;同年8月后隸屬南玉子人民公社管轄;1984年政社分設(shè),設(shè)立南堡子村村民委員會;2002年11月因撤鄉(xiāng)并鎮(zhèn),歸義門鎮(zhèn)人民政府管轄。