建九戶鎮(zhèn)自漢朝有考。
后漢時期屬濟南郡東朝陽縣;南北朝屬濟南郡朝陽縣。
隋開皇六年朝陽縣改為臨濟縣,九戶之域又屬臨濟縣。
宋朝臨濟縣折入鄒平、章丘兩縣。
九戶之域?qū)汆u平縣。
元代將鄒平、章丘兩縣各一部分成立齊東鎮(zhèn)。
憲宗二年(1252)立齊東縣,九戶屬齊東縣。
明清兩代九戶均屬濟南府齊東縣。
齊東縣原治所趙巖口(今臺子)。
光緒二十年被水淹,縣治始遷至九戶鎮(zhèn)。
民國時期到建初期,均屬山東省境域原屬齊東縣。
1949年為九戶區(qū),1958年11月份,齊東縣撤銷并入鄒平縣,建九戶公社,1961年改區(qū),1966年并入孫鎮(zhèn)區(qū),1968年復設九戶公社,1984年改鄉(xiāng),1996年12月撤鄉(xiāng)設鎮(zhèn)。