明洪武二十四年（1391年）4月，朱元璋十五子慶王命在此采煤，供王府使用，同時燒制瓷器，始有磁（瓷）窯寨。
[14]解放以后，寧東為新華第二煤礦。
1952年，改名叫磁窯堡煤礦。
1961年9月，由燎原人民公社析出磁窯堡人民公社。
1983年6月，撤銷人民公社設(shè)磁窯堡鄉(xiāng)。
1985年12月，撤銷磁窯堡鄉(xiāng)設(shè)磁窯堡鎮(zhèn)。
2004年10月，鎮(zhèn)政府機關(guān)由磁窯堡遷至馬跑泉村黎家新莊（習(xí)慣稱中心區(qū)）。
[14]2005年8月18日，靈武市磁窯堡鎮(zhèn)正式更名為寧東鎮(zhèn)。
2011年，寧東鎮(zhèn)整建制劃歸自治區(qū)寧東基地管委會代管。