龍港區(qū)成立于1983年，當(dāng)時稱葫蘆島區(qū)，隸屬于錦州市。
1989年劃歸升格后的錦西市。
1994年因錦西市更名為葫蘆島市，葫蘆島區(qū)隨之更名為龍港區(qū)。
1995年，龍港區(qū)與省級開發(fā)區(qū)葫蘆島經(jīng)濟技術(shù)開發(fā)區(qū)合并，成為集經(jīng)濟開發(fā)與行政管理于一體的特殊城區(qū)。
2006年3月，葫蘆島經(jīng)濟技術(shù)開發(fā)區(qū)與龍港區(qū)分立，獨立設(shè)立開發(fā)區(qū)管委會，由葫蘆島市委、市政府直接領(lǐng)導(dǎo)，但行政社會管理職能仍由龍港區(qū)行使。
同時，將毗鄰興城市雙樹鄉(xiāng)部分區(qū)域劃歸龍港區(qū)管轄。
2007年10月葫蘆島經(jīng)濟開發(fā)區(qū)船舶制造配套園區(qū)開發(fā)建設(shè)，2010年11月更名為葫蘆島龍港海洋工程工業(yè)區(qū)，2018年1月更名為葫蘆島軍民融合產(chǎn)業(yè)園區(qū)。
2016年6月，龍灣中央商務(wù)區(qū)（CBD）劃歸龍港區(qū)管理。