水洲村由原水洲與水尾村合并而成。
水洲村和水尾村中華人民共和國成立之前均屬永隆鄉(xiāng)。
中華人民共和國成立之初水洲為水洲鄉(xiāng)，水尾屬官村鄉(xiāng)；1956年水洲為水洲高級社；1958年水洲大隊(duì)屬永隆公社，水尾屬官村公社，1964年轉(zhuǎn)屬永隆公社；1968年水尾、水洲合并為水洲大隊(duì)；1972年分開又復(fù)設(shè)水尾大隊(duì)、水洲大隊(duì)；1984年改稱水尾村、水洲村均屬永隆鄉(xiāng)；2003年，水尾村并入水洲村，屬永隆鄉(xiāng)至今。
以境內(nèi)水洲村取名。