解放初期屬隨縣第十四(均川)區(qū)均川鄉(xiāng)。
1955年屬隨縣均川區(qū)光河鄉(xiāng)。
1958年成立公社時(shí)命名為光河二大隊(duì)、光河三大隊(duì),屬綠水(均川)人民公社光河管理區(qū)。
1981年地名普查后,光河二大隊(duì)以其駐地更名為高皇廟大隊(duì),光河三大隊(duì)以境內(nèi)居民點(diǎn)更名為鐘氏祠大隊(duì),屬光河管理區(qū)。
1984年設(shè)區(qū)建鄉(xiāng)、撤隊(duì)改村,高皇廟大隊(duì)改為高皇廟村,鐘氏祠大隊(duì)改為鐘氏祠村,屬光河鄉(xiāng)。
2004年高皇廟村與鐘氏祠村合并為高皇廟村,屬均川鎮(zhèn)至今。