晚清時期(光緒年間)屬石羊鄉(xiāng);民國時期(1923年)隸屬第一區(qū)(縣城);1937年并區(qū)后,屬第一區(qū)(縣城)白鶴鄉(xiāng)楊方會;1950年始建鐘劉村村公所隸屬白鶴鄉(xiāng);1953年成立初級合作社;1957年轉(zhuǎn)入高級社;1958年成立上游(胡金店)人民公社,隸屬白鶴管理區(qū)白鶴公社鐘劉大隊;1970年鐘劉大隊、躍進(jìn)大隊的王楊、吳陳合并改名為長征大隊;1981年1月以地命名,因位于三條港的匯合處而改名三港大隊;1984年元月設(shè)立三港村民委員會,屬胡金店區(qū);1987年9月撤區(qū)并鄉(xiāng),隸屬清明河鄉(xiāng)所轄。
2016年3月,三港村改三港社區(qū),屬清明河鄉(xiāng)所轄。