秦漢時期，北方多戰(zhàn)亂、饑荒，河南、山西、山東、河北農(nóng)民南遷流往荊襄，荊襄流民沿漢江、堵河尋求生存之地，陸續(xù)定在于此地，開山辟地，櫵采而食生存繁衍。
后居民在此開始在此地農(nóng)耕，“插木為標(biāo)，挽草為記”，標(biāo)注自己開墾的范圍；民國20年（1931）賀龍率紅三軍來房縣，開辟革命根據(jù)地后，小峪村隸屬下店二區(qū)蘇維埃政府管轄；民國21年（1932）舊政權(quán)復(fù)辟，民國政府設(shè)立一區(qū)；民國23年，小峪村由一區(qū)管轄的軍店鎮(zhèn)管轄；1949年8月，房縣解放，小峪村由當(dāng)時軍店區(qū)管轄；1952年8月7日，設(shè)立小峪鄉(xiāng)，隸屬二區(qū)管轄；1956年，小峪村隸屬軍店區(qū)管轄；1958年11月11日，根據(jù)中共中央關(guān)于建立農(nóng)村人民公社的決定，小峪村由軍店公社化龍管理區(qū)管轄；1964年底，小峪村隸屬軍店區(qū)管轄；1984年，成立小峪村村民委員會，隸屬軍店鎮(zhèn)管轄；2001年，土城村并入小峪村，沿用小峪村之名；2005年，土坎村與小峪村合并，沿用小峪村村民委員會至今。