清代咸豐年間（約1854年），西留養(yǎng)李姓一戶遷徙于村東南5公里處的丘嶺之中。相傳，先民挖窯鑿洞時顯現(xiàn)一尊圣母神像。圣母手捧形似柿花的器皿，遂尊稱柿花圣母，并以香火供奉，又立村為柿花溝。約清代光緒年間，西軹城村衛(wèi)姓遷來，北官莊葛姓入住。清末，田、馮、閆、尤等姓氏落戶于馬嶺自然村。近代，趙、王、何等姓氏投靠于柿花溝。繁衍生息，發(fā)展壯大。
柿花溝村位處軹城鎮(zhèn)政府駐地西部2公里的丘嶺地帶。東與西軹城村相連，南和黃龍廟村接壤，西至石板溝村，北到東留養(yǎng)村。轄柿花溝、馬嶺2個自然村，3個居民組，共170余戶，772人，耕地面積700余畝。土地改革時，與衛(wèi)溝村合并；合作化時期，和衛(wèi)溝、黃龍廟村同為一社。1958年起，隸屬黃龍廟大隊(duì)。1977年3月，獨(dú)立為行政單位，沿襲至今。
1979年春，柿花溝采用籌資籌勞方式，建占地面積為3000平方米的塑料管制品廠，當(dāng)年投資，即年盈利。1980年，建承包式經(jīng)營方式的漂白粉廠。1983年，籌資貸款，同鄭州化工部門合作，建占地面積為3000平方米的工業(yè)用油漆廠。同年，漂白粉廠關(guān)閉，其廠區(qū)改建預(yù)制材料廠，生產(chǎn)各類建筑預(yù)制板及各種小件。1984年，油漆廠、塑料制品廠停產(chǎn)，改建濟(jì)源市第二人造毛皮廠。村辦企業(yè)發(fā)展，受到新鄉(xiāng)地區(qū)市委表彰。1985年，組建濟(jì)源市第三建安公司，下設(shè)施工隊(duì)7個。1986年冬，土地結(jié)構(gòu)調(diào)整，村民廣種煙葉西瓜等經(jīng)濟(jì)作物，栽培蘋果樹100余畝。1992年，蘋果樹栽培面積擴(kuò)大至350畝。柿花溝集體經(jīng)濟(jì)繁榮，群眾收入提高，1992年，榮獲“焦作市小康村建設(shè)”稱號。1993年，榮獲“河南省先進(jìn)村委會”稱號。1994年，以群眾集資籌款方式，建鐵路貨場，進(jìn)一步夯實(shí)了小康村建設(shè)的基礎(chǔ)，成為軹城鎮(zhèn)的首富村。
1985年，柿花溝村集體搬遷，民居環(huán)境改善。重新安裝了變壓器，改造了高低壓線路，在濟(jì)源縣乃至河南省新農(nóng)村建設(shè)中名列前茅。1998年，采用政府補(bǔ)助、村民集資方式，復(fù)修長1500米、寬6米的出入大道（軹城火車站與濟(jì)源油庫必經(jīng)之路）。2006年，投資50萬元再修。2008年，投資數(shù)萬元，改造村衛(wèi)生所，添置醫(yī)療器材，建立村民健康檔案，提高了醫(yī)療衛(wèi)生水平；投資25萬元，打深水井（120米深），解決了飲水安全問題。2009年，投資15萬元，將村辦小學(xué)（2008年停辦）改造為村民游樂活動場所，添置10余類文體器材。2011年，投資10萬余元，第三次復(fù)修總長度2000余米的田間渠道。2012年，投資8萬余元，整修全長5000余米的田間道路。2014年，投資10萬余元，建垃圾中轉(zhuǎn)站，改善環(huán)境衛(wèi)生。2015年，投資100余萬元，第三次復(fù)修并硬化村莊出入大道；投資80余萬元，硬化總長度2000米的西軹城至村莊的交通大道。柿花溝先后被評為濟(jì)源市“平安村”、軹城鎮(zhèn)“文明村”和“最美鄉(xiāng)村”。柿花溝村黨支部多次被評為市、鎮(zhèn)級先進(jìn)黨組織。