清宣統(tǒng)元年(1909),清廷照準,于臨江州東境烏蘇里江附近設(shè)置綏遠州,隸屬吉林行省東北路道管轄。
1913年1月23日,綏遠州改稱綏遠縣。
1914年6月,隸屬依蘭道(東北路道改稱)。
1929年2月撤銷道制,由吉林省直轄。
同年9月27日,因與山西省綏遠縣重名,綏遠縣改稱撫遠縣。
1934年12月劃歸偽三江省管轄。
1938年將饒河縣撓力河以北地區(qū)劃歸撫遠縣管轄。
1947年隸屬合江省。
1949年5月,劃歸松江省管轄。
1951年4月,撤銷撫遠縣建制,改設(shè)撫遠漁業(yè)特區(qū)。
同年6月,將撓力河以北之東安鎮(zhèn)等地劃歸饒河縣管轄。
1952年8月,恢復(fù)撫遠縣。
1954年8月松、黑兩省合并后,隸屬黑龍江省合江地區(qū)。
1959年4月,將富錦縣同江區(qū)(包括同江、三村、樂業(yè)3個鄉(xiāng))劃歸撫遠縣管轄,并將同江區(qū)改為同江鎮(zhèn),撫遠縣人民委員會由撫遠鎮(zhèn)移駐同江鎮(zhèn)。
1965年,將西部的同江鎮(zhèn)和樂業(yè)、三村、街津口、八岔公社及勤得利農(nóng)場鄉(xiāng)劃歸新設(shè)置的同江縣管轄,撫遠縣人民委員會遷回撫遠鎮(zhèn)。
1985年1月1日,劃歸佳木斯市領(lǐng)導(dǎo),由黑龍江省直接管轄。
2016年1月15日,撤銷撫遠縣,設(shè)立撫遠市(縣級),名稱沿用至今。