解放前設(shè)九堡，為孔寨鄉(xiāng)管轄；1950年為孔寨鄉(xiāng)第三村；1956年為五星高級(jí)社；1962年為納壁鄉(xiāng)五星大隊(duì)；經(jīng)1981年地名普查，更名為三妹孔大隊(duì)；1992年為回龍鎮(zhèn)三妹孔村。
1992年，地名普查和資料更新調(diào)查后，該村寨隸屬于回龍鎮(zhèn)；2007年9月，根據(jù)《興仁縣人民政府關(guān)于對(duì)回龍鎮(zhèn)村級(jí)整合實(shí)施方案的批復(fù)》仁府函[2007]83號(hào)文件，同意將原來山岔村、三妹孔村整合為三妹孔村，原三妹孔村竹林灣組到新馬場鄉(xiāng)云上村，辦公地點(diǎn)設(shè)在原山岔村的村民委員會(huì)辦公室。