解放前孔寨屬增盈鄉(xiāng)第四保，解放初屬增盈鄉(xiāng)第四村，1953年建政后屬朝利鄉(xiāng)，1956年屬增沖鄉(xiāng)，同年建社，名為“三發(fā)農(nóng)業(yè)生產(chǎn)合作社”，1957年屬增沖片，1958年屬停洞公社增沖工區(qū)，同年建孔寨大隊(duì)，1961年屬增沖公社，仍稱孔寨大隊(duì)，1984年8月屬增沖鄉(xiāng)，改稱孔寨村民委員會(huì)。
1992年撤區(qū)并鄉(xiāng)建鎮(zhèn)屬往洞鎮(zhèn)孔寨村民委員會(huì)。
現(xiàn)村民委員會(huì)建于2011年。
2018年3月10日縣政府批復(fù)往洞鎮(zhèn)并村方案，同意孔寨村、貢寨村合并為孔寨村村民委員會(huì)。
得名后使用至今。