民國時期，實行新憲制，改區(qū)、聯(lián)保為鄉(xiāng)（鎮(zhèn)），隸屬冊陽鎮(zhèn)；1958年，建立紅旗生產(chǎn)大隊，成立紅旗生產(chǎn)大隊管理委員會，隸屬冊陽區(qū)者樓公社；1984年，冊亨縣行政區(qū)劃變動，紅旗生產(chǎn)大隊管理委員會更名為紅旗村民委員會，隸屬城關鎮(zhèn)；1991年，實行建鎮(zhèn)并鄉(xiāng)撤區(qū)，城關鎮(zhèn)、高洛鄉(xiāng)和冊陽鄉(xiāng)合并為者樓鎮(zhèn)；1998年，紅旗村委會隸屬者樓鎮(zhèn)；2007年，實行村級整合，紅旗村委會隸屬者樓鎮(zhèn)；2016年，行政區(qū)劃調(diào)整，者樓鎮(zhèn)劃分為者樓街道和納福街道，紅旗村委會隸屬納福街道。