1912年設(shè)瑤上村。
1948年分瑤上、太平2村，屬昭文鄉(xiāng)。
1952年與西就、吉田2村合設(shè)瑤上鄉(xiāng)，屬灌陽縣第六區(qū)。
1955年屬文市區(qū)。
1958年改大隊(duì)，并析出西就、吉田、吉頭3大隊(duì)，屬文市公社。
1962年改公社，西就、吉田、吉頭3大隊(duì)并入，屬文市區(qū)。
1968年復(fù)改大隊(duì)，并析出西就、吉田2大隊(duì)，屬文市公社。
1984年改村并成立瑤上村民委員會，屬文市鎮(zhèn)。
1987年改瑤上村公所。
1995年復(fù)名瑤上村民委員會。
2020年根據(jù)民政部基層政權(quán)的文件要求，改為瑤上村村民委員會至今。