清乾隆年間，村民圍海造田，后來形成居民點(diǎn)，合成片村，取名百頃村。
清道光年間，聯(lián)成百頃大圍。
民國時(shí)期屬第四區(qū)，稱百頃鄉(xiāng)。
1951年改屬第九區(qū)，稱百頃鄉(xiāng)。
1955年屬睦洲區(qū)，稱百頃鄉(xiāng)。
1957年屬百大鄉(xiāng)。
1959年為百頃管理區(qū)上百頃一大隊(duì)。
1961年屬大鰲人民公社，稱百頃一大隊(duì)。
1965年稱百頃大隊(duì)。
1968年分出新一村，稱紅星大隊(duì)。
1982年復(fù)稱百頃大隊(duì)。
1984年稱百頃鄉(xiāng)。
1987年稱百頃村民委員會(huì)。
1988年改稱百頃管理區(qū)。
1999年改稱百頃村民委員會(huì)，沿用至今。