歷史上，先后隸屬于南�？し淼兀ㄇ兀�、博羅縣（漢三國）、寶安縣（東晉咸和6年至唐至德二年），東莞縣（送開寶五年，東莞縣并入曾城先，本村屬增城先，宋開寶六年1937年復(fù)置東莞縣至明碗歷元年）、新安縣（萬歷元年1573年，析東莞縣，置新安縣，明萬歷元年至清康熙五年）、東莞縣（清康熙五年至清末），寶安縣（民國3年、1914年至中華人民共和國成立前）。
1949年10月至1951年屬惠陽縣第四區(qū)：1951年11月至1957年11月屬惠陽縣第七區(qū)；1957年12月至1958年3月屬惠陽大鵬鄉(xiāng)；1958年3月至1958年11月屬惠陽大鵬公社；1958年11月至1983年7月屬寶安縣大鵬公社；1983年7月至1986年10月屬寶安縣大鵬區(qū)；1986年10月至1993年一月屬寶安縣南澳鎮(zhèn)；1993年1月至今屬深圳市龍崗區(qū)南澳街道。
2004年9月，東山村民委員會改為東山社區(qū)居委會，名稱沿用至今。