唐末宋初始有先民定居于此。
北宋至清初,文祠屬海陽(yáng)郡登瀛都。
清至民國(guó)期間稱登榮都。
民國(guó)三年(1914年)后,改為潮安縣登榮區(qū)。
民國(guó)十九年(1930年),屬潮安縣榮意區(qū),與意溪合并。
民國(guó)三十五年(1946年),與意溪分拆,屬潮安縣登榮鄉(xiāng)。
1949年,又與意溪合并稱榮意區(qū)。
1950年,榮意區(qū)稱第三區(qū)人民政府。
1952年,拆三區(qū),文祠建制為文祠區(qū)人民政府,期間轄屬村變更繁迭。
1958年9月,再與意溪并置意溪人民公社。
1961年4月,與意溪分拆,成立公社。
1980年,稱文祠公社管理委員會(huì)。
1983年11月,改置文祠區(qū)公所,轄下大隊(duì)稱鄉(xiāng)。
1987年2月,改為文祠鎮(zhèn)人民政府。
1992年,后屬潮安縣。
2013年6月28日,國(guó)務(wù)院批準(zhǔn)調(diào)整潮州市部分行政區(qū)劃,撤銷潮安縣,設(shè)立潮安區(qū),文祠鎮(zhèn)屬潮安區(qū)。