1949年12月9日,武都縣屬武都專區(qū)管轄(專區(qū)、縣同治城關(guān)鎮(zhèn))。
1958年4月11日撤銷武都專區(qū),武都縣隨武都專區(qū)并入天水專區(qū);12月撤銷康縣并入武都縣。
1962年1月,恢復(fù)武都專區(qū),駐地仍在武都城關(guān)鎮(zhèn)。
1968年7月7日,武都專區(qū)、武都縣革命委員會在武都蓮湖廣場召開成立大會。
1969年10月1日,武都專區(qū)革命委員會更名為武都地區(qū)革命委員會。
1979年1月,武都地區(qū)行政公署成立(駐舊城山)。
1980年12月,撤銷武都縣革命委員會,成立武都縣人民政府。
1985年5月14日,國務(wù)院批準武都地區(qū)更名為隴南地區(qū)。
2004年1月,國務(wù)院批準撤銷隴南地區(qū)和武都縣,設(shè)立甘肅省隴南市(地級市)和武都區(qū)(縣級區(qū)),市、區(qū)政府駐地仍為武都城關(guān)鎮(zhèn)。
2004年6月,武都區(qū)政府正式掛牌。