中華民國時期，屬陜甘寧邊區(qū)新寧縣第五區(qū)第三鄉(xiāng)。
當時南倉村的社火搞得十分熱火，民國33年（1944）11月，村長劉志仁出席陜甘寧邊區(qū)文教英雄大會，榮獲“特等藝術(shù)英雄”稱號，邊區(qū)政府主席林伯渠給他頒發(fā)了“新秧歌運動的旗幟”獎狀，毛澤東還接見了他，送給他一條毛毯。
中華人民共和國成立后，南倉村先后隸屬常家溝門鄉(xiāng)，湘樂鄉(xiāng)；1958年成立南倉大隊，屬湘樂公社；1974年，從南倉大隊析出北倉大隊；1983年政社分設(shè)時更名為南倉村，屬湘樂鄉(xiāng)；1985年撤鄉(xiāng)建鎮(zhèn)，屬湘樂鎮(zhèn)。