鹽茶村前身為鹽茶村和秦州村。
鹽茶村土改時為五區(qū)二鄉(xiāng)一行政。
1955年建鹽茶初級社。
1957年擴建為鹽茶高級社。
1958年為敦煌人民公社紅敦大隊三中隊鹽茶生產隊。
1961年改名為呂家堡公社鹽茶大隊。
1966年又更名為紅敦公社紅旗大隊。
1969年又恢復為鹽茶大隊。
1983年3月改置村。
秦州村農戶是清代秦州（現(xiàn)在的天水市）的徙民于此建秦州坊，后村以坊名。
土改時屬五區(qū)一鄉(xiāng)三行政。
1955年成立秦州初級農業(yè)社，后和鹽茶合并為高級農業(yè)社。
1958年改名為敦煌人民公社紅敦大隊一中隊鹽茶生產隊。
1961年為呂家堡人民公社秦州大隊。
1966年更名為紅衛(wèi)大隊。
1969年又恢復為秦州大隊。
1983年3月改置村。
2007年9月，秦州村省入鹽茶村。