磐石村舊時(shí)屬候官縣管轄，民國(guó)時(shí)期屬閩侯縣管轄，解放前夕屬林森縣管轄，1949年8月17日福州解放初期屬洪山區(qū)管轄。
1953年洪山區(qū)撤消，成立新店區(qū)，磐石屬新店區(qū)管轄。
1958年9月新店區(qū)撤消改稱郊區(qū)人民公社新店分社，磐石屬新店分社管轄，同時(shí)改為磐石大隊(duì)，1979年磐石大隊(duì)屬環(huán)城區(qū)管轄，1982年8月又恢復(fù)福州郊區(qū)管轄，1984年9月磐石大隊(duì)改名為磐石村民委員會(huì)，由新店鄉(xiāng)人民政府管轄，村委會(huì)開始村民自治，1992年新店鄉(xiāng)改為新店鎮(zhèn)，現(xiàn)磐石村委會(huì)設(shè)在王厝頭山北路77號(hào)。