長坑鄉(xiāng)在隋唐時(shí)期屬南安縣地，在唐咸通五年（公元864）安溪始置小溪場時(shí)，則屬小溪場轄地，在五代后周顯德二年（955）置縣時(shí)隸屬清溪縣，在宋宣和三年（1121年）清溪改安溪時(shí)，長坑一直屬安溪縣地，區(qū)劃為金田鄉(xiāng)還集里（11、12都），沿用到明嘉靖元年（1522年），還集里析為還一、還二里，今長坑鄉(xiāng)屬還二里。
一直沿用到1932年10月，全縣劃為6個(gè)區(qū)，開始設(shè)有長坑區(qū)，轄還一、還二、感德、常樂4個(gè)里。
1936年7月，長坑區(qū)改為第三區(qū)署，領(lǐng)西南鎮(zhèn)、劍義鄉(xiāng)、感桃鄉(xiāng)、福珊鄉(xiāng)和藍(lán)進(jìn)鄉(xiāng)；1941年1月，第三區(qū)更名為第二區(qū)；1942年4月，第二區(qū)改為長康區(qū)；1945年1月，長康區(qū)撤銷，屬崇新區(qū)所轄，同年10月崇新區(qū)撤銷，長坑設(shè)長卿鎮(zhèn)，而今的福春、水缸、珊屏、田中、三村等村屬福珊鄉(xiāng)，祥泉村屬藍(lán)進(jìn)鄉(xiāng)。
1949年9月20日安溪縣城解放，正式成立安溪縣人民政府，沿用中共地下游擊活動(dòng)劃分區(qū)域，長坑設(shè)長康區(qū)，轄長卿鎮(zhèn)及藍(lán)進(jìn)、福珊、多卿、潘桃等5個(gè)鄉(xiāng)鎮(zhèn)，同年12月長康區(qū)改為第五區(qū)，轄長卿鎮(zhèn)及尚卿、藍(lán)進(jìn)、樂德鄉(xiāng)。
1950年4月，全縣區(qū)域調(diào)整，仍為第五區(qū)不變，轄長坑、劍斗、感德、翰卿、龍居、溫泉等6個(gè)鄉(xiāng)鎮(zhèn)，29個(gè)小鄉(xiāng)。
1952年7月全縣區(qū)域劃為14個(gè)區(qū)，長坑為十一區(qū)，轄13個(gè)鄉(xiāng)鎮(zhèn)。
1955年9月，十一區(qū)改為長坑區(qū)，轄17個(gè)鄉(xiāng)，十四區(qū)改為珊屏區(qū)。
1956年6月，全縣12個(gè)區(qū)并為7個(gè)區(qū)，長坑區(qū)轄今長坑、藍(lán)田、祥華、感德、桃舟等25個(gè)鄉(xiāng)鎮(zhèn)。
1958年2月，撤銷7個(gè)區(qū)公所，劃為28個(gè)鄉(xiāng)鎮(zhèn)，長坑設(shè)長坑鄉(xiāng)，轄6個(gè)小鄉(xiāng)。
1958年11月，取消鄉(xiāng)建制，全縣重新調(diào)整成立9個(gè)人民公社，長坑設(shè)長坑人民公社，轄今藍(lán)田、祥華、長坑40個(gè)大隊(duì)。
1961年8月，全縣區(qū)域再次調(diào)整，設(shè)8個(gè)區(qū)，長坑設(shè)長坑區(qū)，轄14個(gè)小公社。
1965年4月，撤銷區(qū)建制，長坑區(qū)劃分為長坑、祥華2個(gè)公社，長坑公社轄30個(gè)大隊(duì)。
1981年11月，長坑公社析為長坑、藍(lán)田2個(gè)公社，長坑公社轄22個(gè)大隊(duì)。
1984年7月實(shí)行政社分開，長坑公社改為長坑鄉(xiāng)，今轄區(qū)有26個(gè)村、1個(gè)居民組、1個(gè)茶場；2020年6月撤銷長坑鄉(xiāng)設(shè)長卿鎮(zhèn)。